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唐中和元年（公元881年）九月，朱温所部在东渭桥和唐军大战，随后黄巢又派来尚让加入战斗，唐军被朱温打的没了脾气，离开东渭桥后撤至富平（今陕西富平）。 朱温越打越顺手，十一月，朱温和孟楷部受黄巢指令，北上富平，收拾拓跋思恭和李孝昌。二人已经被朱温打怕了，数战数败，损失重大，二人一合计，干脆回去吧，再在这打下去，本钱早晚要赔光。
中和二年（公元882年）二月，朱温再攻同州（今陕西大荔），朱温没有正面攻取，而是北上丹州（今陕西宜川），然后纵兵南向，偷袭同州。唐同州刺史米诚没什么用，狂奔河中。黄巢得知朱温得手后，封朱温为同州防御使，就守在同州。
黄巢觉得形势略有好转，便想灭掉河中的王重荣。同月，黄巢再祭出他的常胜法宝朱温，让朱温自同州南下，兄弟黄思邺出华阴，两路合兵数万，进击河中。
王重荣自从再归唐朝以来，还没有立过什么象样的战功，既然朱温来了，那就拿他开斋吧。两军战于河中，唐军在王重荣的哭告激励下，士气大振，大败朱温。朱温觉得自己拿不下王重荣，便连上十章入长安，请黄巢速发兵来援。
此时在黄巢身边主事的是左军使孟楷，孟楷和朱温向来不和，巴不得王重荣能作掉朱温，当然不想让朱温过好日子，扣下朱温的急信。朱温左等不来，右等不来，得知是孟楷从中下黑手，不由得大怒：“昏君！用这等下作仆才，如何不误事！”朱温看到唐军四面围集，知道黄巢要坏事了，便动了背叛黄巢的心思。
朱温召来心腹人谢瞳、胡真，一起分析了保黄和降唐的利弊得失。谢瞳劝朱温：“黄主起兵山东，聚众百万，因唐室昏庸，天下纷扰之际，成得大事。但现在朝廷军四围长安，纵魏武复出，能奈何？将军本欲忠于黄主，但黄主信用孟楷，驭军无方，用人不明，他撑不了多长时间了。将军英武聪明，何必在一棵树上吊死？见机行事，才是英雄本色。”胡真也劝朱温降唐，朱温大喜：“天下富贵，我今日不取，复待何日！”
唐中和二年（公元882年）九月，朱温杀掉黄巢派来的监军严实，举军投降王重荣。朱温向王重荣谢罪：“温久事黄逆，罪大恶极，今愿归顺朝廷，将罪建功。”朱温的脸皮比城墙还厚，又道：“若大帅不弃，温愿奉大帅为舅氏，效节犬马。”
王重荣平白多了个有本事的外甥，自然大喜，赶忙认下朱温，并飞使成都报喜。朱温是黄巢的头号王牌，拿下朱温，黄巢已经没几天蹦头了。唐朝文武也都知道这号人物。李儇闻报，喜极而泣：“朱温如此识时务，诚我大唐忠臣也！”拜朱温为河中招讨副使，并赐名朱全忠。李儇哪里想得到，正是这位“朱全忠”后来连弑两位唐朝皇帝，杀尽李唐宗室，毁了他唐家三百年的社稷。
朱温打仗确实有能耐，而且朱温对黄巢知根知底。所以朱温投降唐朝，黄巢手下大惊，也多开始谋划出路，黄巢在长安的统治摇摇欲坠。黄巢闻朱温变节，大怒：“负锅贼！不得善终！”
黄巢军的实力并没有因为朱温的投降而受到实质性的削弱，王重荣心里还是担心。杨复光建议王重荣求援兵，王重荣叹道：“我手头上就这点子兵，加上朱温，不过数万，上哪求兵？”杨复光笑：“代北李克用，骁勇异常，手握强兵，不如招李克用过来，为我们所用。”
王重荣大喜，速告知王铎，王铎知道李克用和郑从谠不和，写信劝郑从谠要从国家大局出发，别给李克用南下制造麻烦，这回郑从谠听了劝。李克用也不想老死代北，他看到各路豪杰都去勤王，知道一旦唐朝中兴，自己没什么军功，以后怎么在江湖上混？既然王重荣来请，自然乐意。
唐中和二年（公元882年）十月，雁门节度使李克用带着四万黑衣沙陀兵南下勤王，不过李克用对郑从谠还会耍什么花招心中没底，不敢招惹这位郑爷，让大军绕道岚州（今山西岚县），沿黄河东岸行进。自己带着几百亲骑路过太原，和郑从谠打个招呼，以后还要和郑从谠打交道，所以这回非常的客气。郑从谠知道李克用打的是勤王旗号，也不敢得罪朝廷，送点东西，打发了事。
黄巢军久闻李克用的沙陀兵凶悍善战，互相惊叹：“黑鸦军来了，我们打不过他的，这可如何是好？”黄巢得知李克用的弟弟李克让曾经被南山寺的僧人杀害，黄巢想让李克用欠他个人情，便派大将米重威押着南山寺的僧人，带着重金和诏书前去沙陀军大营，希望李克用不要插脚。李克用来这里就要发家致富的，哪会任黄巢随意摆布？李克用先杀掉南山寺和尚，哭祭兄弟，然后把黄巢的重金分赏众将，烧掉黄巢的诏书，乱棍把米重威打出去。
二月，黄巢尽出主力，以尚让、黄揆、黄邺、林言、王璠、赵璋等将率大军十五万出守沙华山西北的梁田坡，准备和唐军决一死战。李克用见机会来了，立刻会集河中王重荣部、忠武周岌部等各道，阵列严整，逼进黄巢军。两军以骑兵为先锋，步兵随后，狂呼着冲杀在一起。沙陀人实在强悍，王重荣等部也不示弱，死命击杀黄巢军。
此役惊天动地，喊杀声震出数十里，狂风肆起，旌旗扑猎，血肉迸飞。黄巢军人心不稳，打到夜幕时，黄巢军大败，死伤数万，尸体遍于野路。梁田坡败后，黄巢已经无力再发动大规模的战役，唐军进一步勒紧了套在黄巢头上的绞索。
黄揆、黄邺兄弟带着残部去袭华州（今陕西华县），华州刺史王遇见黄氏兄弟要吃人，吓跑了，黄巢军入城据守。李克用初次建捷，心气极高，率军急追，沙陀军杀到华州，未做休息，开始攻城。
黄巢困守长安孤城，形势日益恶化，黄巢为了给自己留条后路，派三万军去守蓝田，一旦不利，好东出蓝田道，进入河南。华州被围，黄巢再派大将军尚让速领本部兵去在李克用背后捅刀子。李克用不想被尚让和黄揆夹成了三明治，率沙陀军折回逆击尚让。
沙陀气势如虹，在零口（今陕西临潼东北）再败尚让，尚让属狗熊的，打不过就跑。华州城中的黄氏兄弟见援军被打败，吓的逃出华州。李克用知道起义军现在最缺的就是粮食，李克用来了一招釜底抽薪，派部将康君立、薛君勤等人每天晚上率领轻骑后前往长安烧粮，破坏黄巢军仅有的一些粮食储备，饿死黄巢军。
中和三年（公元883年）四月，李克用联合忠武军庞从部、河中军白志迁部提兵先进，逼进渭南（今陕西渭南），黄巢也做最后一博，可惜军心已经大乱，战斗力急速下降，一日三战，尽皆败北。唐军主力随后赶到，黄巢军大溃，黄巢知道这时已经无法再呆在长安了，必须寻找生路。黄巢集合剩余的人马，先放火烧了长安城，然后趁夜色朦胧之际，经蓝田关出商洛东下河南。
李克用等各路军阀耀武扬威的进入长安，这伙官军刚进城，就四处抢掠，看什么东西值钱抢什么，把一座锦绣长安城弄的破败不堪。虽然封建史家痛恨黄巢义军，但对这些“官军”的丑陋行径进行严厉批判，说“官军暴掠、无异于贼。”等抢完长安的东西之外，这些“官军”又盯上了黄巢，黄巢早就想到了这点，让手下把值钱的东西都丢到路上，等官军们去拿。这些官军还真如黄巢所料，见着宝贝就走不动了，一窝蜂的抢，也没人去关心黄巢跑哪去了。
收复长安后，杨复光遗使赴成都告捷，以李克用为首功，请皇帝褒赏三军。李儇呆在成都差不多两年了，日思归家，得闻长安告复，惊喜而泣，百官联袂入贺。李儇下诏大封各路好汉，因李克用功劳最大，所以李克用得到的报酬最多，封陇西郡公，河东节度使，并调郑从谠回成都，另有任用。太原是北方重镇，得太原者必能成大事，所以李克用后来据守太原，成为和朱温并列的天下两大镇。
李克用初出江湖，这年只有二十八岁，便立下如此大功，各镇为之侧目。李克用年少气盛，加上沙陀军剽悍的战斗力，李克用一时风头无二。因李克用有一只眼近乎失明，江湖人送雅号“独眼龙”。而收复长安功劳不下李克用的朱温也得到了一块肥肉，唐僖宗封朱温为宣武军（治今开封）节度使。与太原一样，汴州同样是天下重镇，朱温守住中原，并以此为基础，四向攻掠，最终建立梁朝。朱温比李克用大四岁，都是一时之才俊。
二人得了彩头，自然高高兴兴的去赴任，朱温到任后，发现汴州也不是个安乐享福的所在，连年战乱，内外交困，但既然出来混江湖，遇到点挫折就缩头，这绝不是好汉所为。朱温励精图治，治军严厉，人多畏服。李克用面临的和朱温一样的困难，李克用也是一代枭雄，能力手腕俱有，李克用不象朱温来硬的，先下令安慰河东军民，河东形势日渐稳定。
朝廷一片喜气，却忘了黄巢还活着。唐中和三年（公元883年）五月，黄巢余部开到了千里之外的蔡州（今河南汝南），蔡州刺史秦宗权出城打了几仗，黄巢余勇可贾，把秦宗权打的一败涂地。秦宗权能屈能伸，投降了黄巢，大家一起发财。
黄巢看到唐军的主力多集中在关中，河南兵力空虚，便决定在河南境内开辟第二战场。五月，黄巢率军攻打陈州（今河南淮阳），以孟楷为前锋先行至项城（今河南项城）。赵犨算定黄巢要来打他的主意，早就准备好了。赵犨埋好伏兵，带着一部兵来引诱孟楷，孟楷是个傻大，不知道是计，大喜前来，结果伏兵四出，大败黄巢军，活捉孟楷，斩于阵前。