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爆炸没有发生，大家都放心了。柯南埋怨不该相信千钧的糊涂推理，幸好小兰剪断了蓝线。千钧有些疑惑，自己的判断真的错了吗？麻美问千钧，“这个小孩是谁，说话好奇怪。”千钧只好将柯南介绍给麻美，麻美非常喜欢，觉得柯南好可爱，就将柯南接过来抱在怀里。柯南趁机用手摸麻美的前胸柔软处，千钧暗道，这家伙，每次都这样占便宜。随后，在大家震撼中，千钧用乌金重剑加上土木系力量击破了那些岩石和堵死的大门，凿穿了通道。里面的人都跑了出来，麻美将柯南放下，她的同学们也都从上面下来了，就这样，麻美被同学们簇拥着离开了。小兰走出来，也没有看到麻美。
随后大楼外，上演了一幕幕悲欢离合的喜剧，大部分人都逃了出来，跟家人朋友拥抱欢呼，但也有不少人葬身大楼，家人痛哭失声。也有人生死未明，他们的家人还在焦急的等待。超过上千人受伤，到处都是忙碌的身影。妃英理抱着小兰放声大哭，小五郎也第一次喜极而泣，目暮警官大力拍着他的肩膀，“太好了，毛利老弟，小兰这不是平安无事了嘛！”千钧放下柯南，却受到了父母、小妹的严厉批评，千钧为了调节气氛，摆了个很酷的姿势，“我是不死鸟、火凤凰，伟大的凤凰战士又复活归来了！”晓月扑哧一声笑出声来，凤凰战士是她的动画里面的杰作，形象已经深入人心了，连横野正一都知道是什么意思。代子的眼泪又忍不住流下来，“你这个孩子就不让我省心，没有正形，什么事情到你那里都变味了！”
几个女孩一起上去饱以粉拳，“让你害我们担心！”“让你不接手机！”“让你逞能！”“下次再乱来，咱们就没完！”看着他们在一起嬉闹，藤野树人和阿笠博士都露出欣慰的微笑。横野正一道，“有机会，我要好好教训一下这个小子！他还真以为自己是外星人了！”新庄剑仁也有同感，“无知者无畏，不让他吃些苦头，以后还要乱来的，我这个师父也有很大责任啊！”花井有些好奇，“千钧，你是怎么做到的？就凭这把剑？能不能让我看看……”千钧笑着将乌金剑递给花井，“亚希子，剑很重的，今天可全亏了它才能顺利把大家救出来。”
花井接过来，可根本就拿不动，只好双手勉强拖住了剑柄，“我的天，太重了……”千钧急忙将剑取回来，花井擦汗，“你真的像是外星人！”直子笑道，“他才不是什么外星人，是个怪物。就像小说里面的那些大力士或者超级猛将一样！”静杨也道，“千钧如果生在冷兵器时代，一定是勇冠三军的大将！”小雅接话，“以前我看那些演义小说，里面总有一两个力大无穷的万人敌，我原本以为都是夸张，后来就知道这个世上真有这样的变T！”千钧黑脸，“小雅，你能不能用点好词？……”
大家正在嬉闹之际，森谷教授冷笑，“别高兴太早了，中间楼层的炸弹就要爆炸了！里面还有不少被困的人吧！”白鸟急问，“你到底把炸弹装在哪里了？”森谷摊手，“我怎么知道？现在都坍陷成这样，我也不知道掉到哪里了，哈哈……”这时，楼层里面传来欢呼声，拆弹组报告松本警视，第二颗炸弹顺利拆除了。森谷帝二脸色变得很难看，“怎么可能呢？你们怎么这么快就找到了那颗炸弹？”柯南也好奇，千钧笑道，“我在冲上高层时，在某个楼层发现了炸弹的大概位置，随后就告知了拆弹组组长。我们从上面下来时，他们就找到炸弹的具体位置，开始拆弹了。”“你的第六感也太强了，难道你真的是圣闘士吗？”“哈哈，这是平成年代最大秘密了！”
毛利夫妇正在向目暮、松本道谢的时候，无数记者蜂拥而上，请毛利侦探讲几句，他们都误以为森谷帝二是毛利侦探抓获的。小五郎立即开始吹嘘，“说实话，这次的炸弹事件，犯人想毁了我名侦探的声誉，才会设计我女儿小兰掉到他的陷阱里……”妃英理实在看不下去，叮嘱小兰，“你离那个侦探男朋友远点，每次都弄出这么危险的事情来，要你跟他分手，就是不听……”小兰见妈妈开始唠叨，“这次不是成功脱险了？我自己的事我自己做主……”“这次？还有下次啊？你不可能每次都这么幸运……”小兰急忙转移话题，“妈妈，你要不要趁这个机会跟爸爸和好？”妃英理哼了一声，看了一眼还在吹牛的小五郎，“我可不想人们知道我的丈夫是个吹牛说大话的糊涂侦探！我先回去了，你赶快回家吧！”
小兰答应一声趁机离开，去找新一。柯南刚刚用变声器以新一的名义打电话将麻美哄回家，麻美走的时候将一件蓝色衬衫交给阿笠博士，托他转交给新一，博士苦笑着答应下来。小兰跑过来，“柯南，你是担心我才来的吧？”柯南点头，小兰奇怪，“你那个绷带是怎么回事？”柯南挠头，“刚才不小心跌倒了，呵呵。”小兰叮嘱他以后小心点，“你有没有看到新一？”柯南假装一愣，“奇怪，他刚才还在这里跟千钧哥哥说话呢。”小兰大为恼火，“人家好容易买了礼物要送给他的。”
柯南急忙转移话题，“说起来，新一哥哥刚才一直觉得不可思议，他以为小兰姐姐一定会按照他和千钧说的将2条线都剪掉的，不懂你为什么改变主意剪掉了蓝线？”小兰一愣，“没有啊，我本来真的打算剪掉蓝线的，不过我相信新一和千钧的共同判断，我也觉得那个阴险的教授不会给我们50%的机会逃生的，所以就将2条线同时剪掉了。”柯南这才明白，自己错怪了千钧，千钧的判断是正确的，幸亏小兰没有听见自己最后的告诫。
二人说话间，看到园子从远处喊着“小兰”跑过来，小兰立刻迎上去，二人抱在一起，园子大哭起来，小兰反而安慰起园子来。原来，园子看到新闻后，想起小兰她们都在这里，担心的要命，就要立即赶过来，家里人怕她有危险，一直拦着。等到电视上播出第一个炸弹被拆掉后，园子才摆脱家人出来。
大家说话之际，千钧抬头，见高层的大火越来越大，大叫，“不好，第3个炸弹要被大火引爆了，我们快离开这里！”大家都吃了一惊，急忙向远处跑去。松本和目暮等人脸色大变，松本拿起扬声器，大声呼喊，让大家赶快疏散。森谷帝二哈哈大笑，在笑声中，爆炸终于传来，整个高层就像给掀开了盖子一样，带着火球、凌厉的碎片像流星火雨一般向四面八方飞射而去，附近的建筑都被波及起火，现场直播的2架直升飞机被当场击中，高空中引起火球，如同盛大的烟花四射，绚丽多姿。而伟大的生命有时候就是那样的脆弱，爆炸摧毁了一切。
千钧拿着重剑在后面给家人、朋友们断后，不断击落空中落下火球和石块。千钧的强大，第一次完整地展现出来，尤其是花井的震撼最大，她亲眼看见一个火球向自己这边飞过去，却被千钧随手挥剑劈开，掉落到其他方向。新庄武平露出笑容，“千钧的以气御剑终于大成了，好好好！”他们这些人只是惊讶千钧的能力，而其他人就没有那么幸运了。不少人被火球击中，惨叫着在地上滚动。无数的车辆，包括消防车、警车、救护车被击中后发声大爆炸，那些气垫都被点燃，冲天的火焰映红了大楼四周。一些聪明机警的人，见来不及跑出去，就逃到大楼里面，暂时保住了小命。更多的人不是被石块击中死亡或者重伤，就是被火球引起的车辆爆炸波及飞向高空，魂归大地。
5分钟后，爆炸和火焰终于结束了，摩天楼的高层都消失了，楼上的大火也渐渐消弱了。楼里救援队员、消防队员、拆弹组、防爆组还有没有离开的人、被困的人大多数都平安无事，也有倒霉蛋被波及到，受了轻重不等的伤，但没有人当场死亡。摩天楼四周，却变成了人间地狱。断肢残体、车辆残骸以及弥漫在空中烧焦的汽油味道，发散的炸弹气息，构成一幅恐怖的灾难画卷。
逃生的警官们鸦雀无声，所有人都惊得说不出话来，森谷帝二在白鸟和高木的拉拽下也逃过此劫，在旁边喋喋不休的惋惜，“可惜啊可惜，爆炸的场面非常灿烂，充满了艺术美感，但不够宏大，要是那2颗炸弹也先后爆炸，这周围就可以夷为平地了，那才是完美的艺术，建筑就算消亡也应该像樱花一样凋零飘落充满美感。”大家气得七窍生烟，佐藤掏出手枪就想击毙森谷，目暮警官和松本警视急忙抱住她，夺下她的手枪，“佐藤警官，你冷静点，法律会给他一个公正的判决，你不可以这么做！”“为了这种超级人渣，不值得的！”大家也都纷纷劝阻，才把佐藤的怒气安抚下去。
刚才散在大楼周边的人，能有一半逃出来，就算不错了，当中有不少是楼里人的家属，更多的是好奇围观凑热闹的群众。千钧他们这帮人都比较幸运，因为千钧及时示警，大家抢先跑开，多数人都没有事情，只有个别人被瓦砾擦伤。令大家惊奇的是，因为被记者围住，落在后面的小五郎，居然毫发无损地逃了出来，他身边的记者就没那么幸运了，消失了一半，剩下那一半也是人人带伤，大家感叹这家伙真的死神，小兰庆幸，还好妈妈刚才离开回去了。
周围都是哀嚎惨叫声，大家亲眼看见刚刚脱离劫难的一对情侣，被火球击中烧得面目全非，体无完肤。他们的家人侥幸逃生，在旁边放声大哭。他们刚才还在庆祝劫后余生，谁知道灾难随后又来了，那种悲喜失落、巨大的打击让很多人都晕了过去。空气中弥漫中烧焦气味，天空开始飘落黑雨，死者的样子惨不忍睹，受重伤的人也凄厉哀嚎。女孩们都不敢再看了，捂着鼻子转过身去。幸存的人也都害怕了，争先恐后地离开，“快跑吧！”“说不定还有炸弹！”“这里太危险了！”“警察干什么吃的，还有炸弹啊，为什么不早点告诉我们啊！”
松本警视脸色很难看，这下东京警视厅不知道怎么向上面交代，这次死亡的人数恐怕不下千人，受伤的更多，不知道多少人家破人亡。目暮警官揪住森谷，“混蛋，大楼里面还有炸弹吗？你到底装了多少炸弹。”森谷冷笑，“我早就告诉过你们了，是你们自己太大意了，以为拆掉了2颗炸弹就高枕无忧了，简直太天真了！放心吧，最大的炸弹也爆炸了，剩下的都是些小炸弹，威力不大，那是我用剩下的火药和材料胡乱制成的，最多也就能炸死几个人而已……”“这个混蛋，你会下地狱的！”松本警视咬牙，“让所有群众、记者都马上离开，我们再也承受不起任何损失了。在场的所有的警员都到里面救人，让消防局、医院加派人手，所有的警察都上街巡逻，防止有人趁乱打劫，我马上调集更多人来救援。”
毛利侦探走过来，“目暮警官，松本警视，我以前也是警察，我可以留下来帮忙的。”所有的警察都露出恐惧的神色，目暮警官咳嗽一声，“毛利老弟，你的好意我们心领了，可你毕竟已经退出警界了。你也要为女儿着想，不是吗？”小五郎想起小兰，只好点头，转身招呼小兰和柯南一起离开。警察们都松了一口气，“这个死神总算走了！”“我可不想跟他在一起共事！”“太危险了！目暮警官不该带他过来的！”“是啊，刚才在他身边的记者不是挂掉就是重伤，他竟然一点事情都没有，太邪性了！”
目暮警官犹豫一下，咬了咬牙，“佐藤，你把森谷帝二先押回警局，顺便向上峰报告这里的详细情况，然后在警视厅待命，负责居中联络。这是命令，不准讨价还价，马上走！”大家都明白，目暮不想佐藤留在这个危险的地方，不过，大家也都不想佐藤有任何危险，都露出善意的微笑。佐藤无奈，押着森谷帝二离开。警官们立即开始着手抢救那些还有生息的遇难者，一会儿，来了更多的救援人员，整个东京都被调动起来，当局甚至出动了地震救援小组协助搜救生还者。
千钧他们也都一起离开，大家开来附近的车大都被摧毁了。也有几个人的车停在远处的停车场，幸免于难。正在发愁之时，横野一夫亲自开车领着一帮保镖手下过来接人，他也知道了事情的严重性，并亲自带队来接应家人。随后大家都陆续接到朋友们的电话，询问是否平安。千钧接到很多朋友的电话，猿野飞霄、土曾普立、田口立彬、文良、云灵、浅井成实、藤森香保留、会泽、中道、财城武彦、旗本夏江、泽木叶子、冈谷典子、松本小百合、竹中一美。
到最后，表妹千寻和舅妈波野、外公千水一木都打来电话，他们在关西也看到了现场直播。刚刚离去的内田麻美也打来电话，千钧笑着告诉他新一也很平安。大阪服部平次也来电话问好，千钧跟他笑闹几句，平次气恼，挂断电话，“真是的，有这个超级怪物在，工藤怎么也不会有事的，我早该想到的，还被他们两个奚落一番。”柯南也收到侦探团的问候，还有工藤夫妇从国外的紧急长途。就这样，工藤新一的生日在最难忘的夜晚来到了，所有人都永远记得摩天楼的大灾难，以及难忘的各种情感，亲情、友情、爱情。天边开始出现彩霞，太阳就要升起来来，新的一天又到来了，灾难即将过去，美好的希望依然在前面招手。
森谷帝二人虽然恶劣，但没有撒谎，剩下的炸弹威力的确不大，在经过一天一夜的抢救后，还是有不少人被从楼里救出来，救援队也找出了不少遇难者的尸体，各个医院都人满为患。虽然救援队依然没有放弃最后希望，还在大楼废墟中用生命探测仪寻找幸存者，但大家都知道剩下的应该没有多少人能生还了。警视厅已经尽了最大的努力，有多位警员殉职，也因此得了社会各界的谅解，更何况他们还抓到了凶手。工藤新一爽快地将这次抓获森谷帝二的功劳都推掉了，让给警视厅，既卖了人情给东京警视厅，又掩藏了自己仍然在世的消息。只有千钧抱怨，一个s级奖励就这样没有了。
尾声，经过事后统计，引爆摩天楼之案中，有将近800人死亡（其中包括不少被波及到的群众和记者），受伤人数达到3千人，其中重伤也有900多人，比松本警视估计的死亡人数要少很多。目暮他们都明白，这多亏了千钧和新一的帮助，还有救援小组等人的努力，有超过3千人完好无损地逃出米花市大楼。森谷帝二因策划多起纵火、爆炸等K怖行动，造成重大的伤亡和经济损失，被法庭判处死刑。警视厅功过相抵，没有受到惩处，除去殉职的警员和拆弹组、救援队，其他警员也都没有受到嘉奖。柯南猛然发现自己与小兰之间没有红线，身为柯南毫无希望。千钧却惊奇发现，花井亚希子对自己的态度开始有了转变，不再是以前那种冷冰冰拒人千里之外的表情。