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肖天磊端坐在云床之上，意识海浩瀚如鸿蒙宇宙。其中黑色陨星中的紫色印记正在与意识海合二为一。当肖天磊领悟其中大半内容后，竟是感觉到了境界修为的轻微增长。而除此之外，让肖天磊最为震惊的，那紫色印记除了拥有灵魂生机之力外，竟还是一信息碎片。
鸿蒙，混沌，洪荒，这三者一一演化。天道控洪荒，大道控混沌，那么鸿蒙宇宙又为谁掌控呢？肖天磊自身修炼的《鸿蒙至尊诀》乃是在其重生至鸿蒙，鸿蒙幡认主后由，自主射入了肖天磊脑海之中。至于其来源所在，肖天磊不知道，甚至从未去仔细想过此物出处。而额心的水滴型印记也是在同一时刻进入肖天磊身体的。现在，黑色陨星中的印记告诉肖天磊，掌控鸿蒙者，便是《鸿蒙至尊诀》中的鸿蒙圣尊！
这对肖天磊而言，不得不说是一极大震撼。肖天磊没有想过，修炼《鸿蒙至尊诀》的，并非自己一人，而且那修成鸿蒙圣尊境界的，还是鸿蒙掌控者！
肖天磊修炼至鸿蒙天尊境界后便止步不前，似乎其后续境界如镜中花水中月。但现在，肖天磊才知道，自己先前所追寻的一切，已然步入了误区。力量也好，心境也罢，都不是突破此层境界的重点所在。真正的精要，乃是“宇宙”而已。
时间谓之“宇”，空间谓之“宙”。宇宙者，便是时间与空间的集合体。鸿蒙世界演化混沌世界，混沌世界演化洪荒世界，这一切便是时空之宇宙的表征。只要掌控宇宙，便可突破瓶颈，成为世界之主。
肖天磊肉身早已在鸿蒙元气的淬炼下达到了一不可思议的程度。早在洪荒未演之时，肖天磊便已察觉到了体内细胞的变化。而在吸收了黑色陨星中的紫色印记之后，这种变化也越发的强烈起来。终于，肖天磊心神一动，神识便进入到了一个细胞内。
肖天磊的神识变化成紫色光点，待聚在一起后，赫然形成了肖天磊身形。肖天磊看着眼前不停变换的各种气息，感受着其中的各种规则之力，肖天磊终于知道，自己的细胞，正在演化鸿蒙宇宙！
当肖天磊知晓了这一点，便是自己也震惊不已。原来，肖天磊体内细胞的变化都是凭借修炼《鸿蒙至尊诀》自主产生变化，而真正的主人肖天磊却并没有意识到这一点。即便是体内细胞吸收了灵魂生机，鸿蒙宇宙中的大千规则依旧是紊乱无比，没有正主掌控凝练，永远都不会真正演化成一个世界。
而那出现的一份紫色印记，解开了这些“秘密”。就像一把通往至尊大道的钥匙，印记之中正是包含了这些时空规则之道。
肖天磊神识凝聚出的化身便在这片混乱天地之中端坐，所有一切的特殊力量自主绕开了肖天磊所在。结合紫色印记中承载的信息，肖天磊进入了深度领悟之中。
时间并不因为肖天磊进入深度修炼中而停止流逝，洪荒天地按照天道所演大势往前行进着，没有任何人可以阻拦。人族之中，许多部落越发壮大，其中人数更是数以亿计。而在这些部落之中，开始出现各种司掌事物的大将及有才有智之士，引领部落中的族人进行生产活动。人族，终于出现了国家机器的雏形了。
九千年后，人皇神农功德圆满，得天降功德入火云洞潜修。而接替神农成为人皇的，正是大能轩辕氏。轩辕氏得掌人皇大权，开始命令人族主动进攻一些猛兽聚居之地，以此扩大人族居地。轩辕氏性格刚毅，更兼有杀戮之气，使得人族之中开始出现反对之声。终于，人族分裂成三大部族：九黎，烈山与有熊。其中轩辕氏所在便是有熊一族。
三大部族皆为人族，轩辕氏为人皇，名义仍是三族之主。只是三族中的九黎族，族人却非同寻常。九黎族人，身形壮硕，天生便拥有大能力，其中厉害者甚至可以随意召唤五行之力，移山填海亦不在话下，与族人中许多修行近千年的修士相仿。因此，九黎者，亦被称之为神族。
原来，在巫妖大劫之前，巫、妖、人三族共处。巫妖虽是死敌，但却也不易遇见一处，而人族与妖族亦是处于敌对态势。因此，巫族与人族越走越近，渐渐地，两族间开始了通婚。巫族不再靠祖巫精血繁育，可与人族结合产下后代。人巫生下的子嗣有些与普通人族一样，拥有先天道体，修炼起来事半功倍；而有些则继承了巫族天生神通，一生下便可使用巫力，而且还可变化出巫族原形肉身，甚是厉害。
随着人巫二族关系渐近，人巫结合所生后代又开始结合。只是，其中巫族血脉却是开始淡化，许多新生命便被划归至人族。后来，巫族虽几近覆灭，但巫族血脉却在人族代代繁育中不曾退去。直到神农退位，轩辕氏成为人皇后，这些拥有巫族血脉的人族，体内巫力忽然开始觉醒，力量与修行千岁相似。这本是人族喜事，有了这些力量，人族当更加强势。但后来却因为各种各样的原因，使得人族产生分歧，这些拥有巫力的人族分裂出去，便成了九黎一族。
有熊部落乃轩辕氏亲随。有熊与九黎敌对，烈山中立。而各个族下又有部落无数，部落中也有了国家机器的雏形，以致三族之下多有争斗。不过，这种争斗规模较小，一直不曾登上台面。
九黎兴盛，族长更替，新的族长乃是一拥有往日巫族大巫之力的壮汉，名为蚩尤。除此之外，所掌部下中亦有风伯、雨师、九凤、相柳四人。此四人亦有不弱于大巫的力量。蚩尤性邪，争斗杀戮之心极重，渐渐地，对轩辕氏也越发不满。终于，蚩尤整合九黎部落，宣布敌对轩辕氏，并且欲夺其人皇之位。
轩辕氏为神农钦立人皇，其下不仅有人族本土修炼数千年的大能修士，更有许多仙人相助。其中便有三清圣人诸弟子。而且原始天尊弟子广成子更是收轩辕氏为徒，成为帝师，教习轩辕氏法术。
而在轩辕氏登临人皇之位的当天，三清女娲诸圣与人族圣地观礼。忽然，天地一阵震动，一把长剑划破天际径直坠落与中央大洲。长剑煞气冲天，通身更是黑气缭绕，即便是神农等人族大能亦是感到灵魂震颤。而三清女娲在见到那三尺长剑之时，却是互视一笑，然后太清老子将其摄入掌中，以太清**抹去其煞气，更在剑身布下数道阵法。待老子做完一切，剑身已然变成了金黄之色，剑侧更有两条五爪金龙做咆哮之状。而女娲随即用不周残山，结合万年玄铁炼出一剑鞘，配予那新生神剑。
神剑入鞘，由老子赐予轩辕氏，并赐剑名“轩辕”，为人皇随身兵刃！
轩辕氏掌控轩辕剑，蚩尤欲夺人皇之位又岂是那么简单？为了集结力量，蚩尤座下，除了风伯雨师等人，更有不少妖魔夹杂其中。而蚩尤与妖魔为伍，心性也越发邪恶，大有入魔之势。
九黎部落与有熊部落之间的碰撞越发巨大，终于两族之间开始了首战。轩辕势强，蚩尤败退。而蚩尤为一族之长，亦是有智谋之人，随即密派座下九凤入有熊部落。
九凤为女子，虽有大巫之力，但除非变化真身，否则无人识得。九凤以倾城闭月之貌亲近轩辕，最终被轩辕所喜，册立为帝妃。但九凤不知道的是，帝师广成子在原始天尊知会之下已然发觉了九凤真实身份。但九凤实力太强，真身更不被普通兵刃所伤，只能用轩辕剑坏之。于是广成子与轩辕氏共谋一计，以除九凤。
九凤册为帝妃，有熊部落举族贺喜。在宾客散去后，便是洞房花烛，享良辰美景之时。九凤虽为蚩尤部下，但却被轩辕风范所吸引，已然将自己任务忘却大半，一颗真心更是牵于轩辕之身，因此警惕性大降。
洞房花烛之夜，轩辕九凤享鱼水之欢。待九凤极享人事之乐时，轩辕竟是骤然发难，以轩辕剑刺入九凤内府！九凤大恨，然真身已伤，法力大减，不得已只能愤恨逃离。便是广成子祭出法宝，也被九凤强势破开。由此可见九黎大巫之力之强。
九凤事败，轩辕氏率大军攻入九黎部落。蚩尤凶狠，不仅败退轩辕，更是以巫法将轩辕大军困住。后轩辕得天界九天玄女传授奇门遁甲之术，摆阵御敌，终逃出蚩尤围困。
轩辕黄帝座下得仙凡两界相援，后与蚩尤大战与逐鹿之野，与之大战九个日夜，终以轩辕神剑斩下蚩尤头颅。蚩尤败亡，座下妖魔也被轩辕手下大将斩杀殆尽，终于将九黎族重新纳入人皇威势之下。
轩辕黄帝乃是三皇中杀戮最重之人，其人皇佩剑轩辕，正是当日妖族天帝太一与众妖圣炼出的屠巫剑。屠巫之剑，乃是以人族无数生魂为引锻造，可屠巫族强悍肉身。这一切皆是天定大势。无论是轩辕剑的出现，还是蚩尤之魔性背叛，都是天道的杰作。而蚩尤，终为轩辕黄帝证道途中一试炼之石，纵为一世枭雄，又有何缘可为人族之皇？